- Системная биология - модели

Презентация "Системная биология - модели" (8 класс) – проект, доклад

Слайд 1
Слайд 2
Слайд 3
Слайд 4
Слайд 5
Слайд 6
Слайд 7
Слайд 8
Слайд 9
Слайд 10
Слайд 11
Слайд 12
Слайд 13
Слайд 14
Слайд 15
Слайд 16
Слайд 17

Презентацию на тему "Системная биология - модели" (8 класс) можно скачать абсолютно бесплатно на нашем сайте. Предмет проекта: Биология. Красочные слайды и иллюстрации помогут вам заинтересовать своих одноклассников или аудиторию. Для просмотра содержимого воспользуйтесь плеером, или если вы хотите скачать доклад - нажмите на соответствующий текст под плеером. Презентация содержит 17 слайд(ов).

Слайды презентации

Системная биология - модели. М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс
Слайд 1

Системная биология - модели

М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс

системная биология - модели. потоковые линейное программирование эксперименты Виткуп Палссон – необычные источники Палссон – мутанты кинетические – метаболизм регуляторные
Слайд 2

системная биология - модели

потоковые линейное программирование эксперименты Виткуп Палссон – необычные источники Палссон – мутанты кинетические – метаболизм регуляторные

Потоковые модели – стационарное состояние. Задаем список реакций (стехиометрические соотношения) Задаем балансы метаболитов (синтезируется столько же, сколько расходуется) Задаем другие ограничения (состав среды) Максимизируем производство биомассы (её состав задан) или чего-то еще (АТФ) Это сводитс
Слайд 3

Потоковые модели – стационарное состояние

Задаем список реакций (стехиометрические соотношения) Задаем балансы метаболитов (синтезируется столько же, сколько расходуется) Задаем другие ограничения (состав среды) Максимизируем производство биомассы (её состав задан) или чего-то еще (АТФ) Это сводится к задаче линейного программирования: выпуклый многогранник задан линейными ограниченими типа равенств (балансы) и неравенств (положительные потоки), надо максимизировать линейный функционал

Уравнения баланса
Слайд 4

Уравнения баланса

Пространство решений
Слайд 5

Пространство решений

Что получается (кишечная палочка). заведомо таким образом можно предсказать принципиальные ограничения на выход продукта – полезно для биотехнологии Удовлетворительно предсказываются потоки в стационарном состоянии если лимитирует углерод если лимитирует азот – хуже потоки при необычном источнике уг
Слайд 6

Что получается (кишечная палочка)

заведомо таким образом можно предсказать принципиальные ограничения на выход продукта – полезно для биотехнологии Удовлетворительно предсказываются потоки в стационарном состоянии если лимитирует углерод если лимитирует азот – хуже потоки при необычном источнике углерода предсказываются хуже но хорошо после того, как на этом источнике жило много поколений – приспособление за счет регуляции?

мутанты. фенотип предсказывается хорошо – но не надо было огород городить, достаточно рассмотреть топологию карты метаболических путей (если в результате мутации сильно удлинились пути до необходимых метаболитов, скажем, входящих в биомассу, то такой мутант не живет) к тому же тут внутреннее противо
Слайд 7

мутанты

фенотип предсказывается хорошо – но не надо было огород городить, достаточно рассмотреть топологию карты метаболических путей (если в результате мутации сильно удлинились пути до необходимых метаболитов, скажем, входящих в биомассу, то такой мутант не живет) к тому же тут внутреннее противоречие – данные о реакциях принципиально неполны, пропущенная (отсутствующая в списке) реакция полностью эквивалентна мутации и впрямь, находили новые реакции (в кишечной палочке) потоки предсказываются плохо, но: надо смотреть не глобальный экстремум, а точку в многограннике, ближайшую к старому экстремуму – тогда все правильно приличные предсказания, если прошло много поколений – приспособления за счет регуляции?

кинетические модели. система дифференциальных уравнений, описывающих реакции их (изолированного) пути
Слайд 8

кинетические модели

система дифференциальных уравнений, описывающих реакции их (изолированного) пути

пример (абстрактный)
Слайд 9

пример (абстрактный)

система уравнений
Слайд 10

система уравнений

разные виды кинетических уравнений
Слайд 11

разные виды кинетических уравнений

пример (реальный) – синтез лизина в Corynebacterium glutamicum
Слайд 12

пример (реальный) – синтез лизина в Corynebacterium glutamicum

кинетические уравнения. фосфоенолпируват карбоксикиназа пируват карбоксилаза L-аспартат амино- трансфераза
Слайд 13

кинетические уравнения

фосфоенолпируват карбоксикиназа пируват карбоксилаза L-аспартат амино- трансфераза

проблемы. сложно как вычислительно, так и (главное) содержательно основные проблемы помимо вычислительной сложности неустойчивые системы диф. ур. много параметров, часто не известных оценка параметров прямая (редко) косвенная – подгон решений под известный ответ (например, по зависимости концентраци
Слайд 14

проблемы

сложно как вычислительно, так и (главное) содержательно основные проблемы помимо вычислительной сложности неустойчивые системы диф. ур. много параметров, часто не известных оценка параметров прямая (редко) косвенная – подгон решений под известный ответ (например, по зависимости концентраций веществ) – минимизация отклонения правила гигиены: оставить часть экспериментальных данных (не использовать при подгонке), потом проверить, насколько хорошо они воспроизводятся

результаты. при аккуратной работе удается предсказать эффект мутаций, оптимизировать систему, предсказать эффект замены ферментов (изменения констант, снятия ингибирования и т.п.)
Слайд 15

результаты

при аккуратной работе удается предсказать эффект мутаций, оптимизировать систему, предсказать эффект замены ферментов (изменения констант, снятия ингибирования и т.п.)

кинетический анализ регуляции. то же самое, только меряют концентрации факторов транскрипции, образующих регуляторную сеть нет хороших результатов
Слайд 16

кинетический анализ регуляции

то же самое, только меряют концентрации факторов транскрипции, образующих регуляторную сеть нет хороших результатов

Системная биология - модели Слайд: 17
Слайд 17

Список похожих презентаций

Что изучает биология?

Что изучает биология?

Цели урока. 1. Формировать диалектическое представление о природе. 2. Дать представление о биологических науках. 3. Показать многообразие форм и богатство ...
Что такое биология?

Что такое биология?

Биология (от греч. bios — жизнь и logos — учение), совокупность наук о живой природе. Предмет изучения — все проявления жизни: строение и функции ...
Регенеративная биология и регенеративная медицина

Регенеративная биология и регенеративная медицина

РЕГЕНЕРАТИВНАЯ БИОЛОГИЯ как НАПРАВЛЕНИЕ ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ БИОЛОГИИ: РЕГЕНЕРАЦИЯ как БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФЕНОМЕН -. ЖИВЫЕ ФОРМЫ ХАРАКТЕРИЗУЮТСЯ СВОЙСТВОМ – ...
Системная работа с учебником на уроках биологии

Системная работа с учебником на уроках биологии

Актуальность темы. Слаборазвитая речь Плохо понимают что прочитали Не владеют материалом Не понимают материал. Научить работать с учебником , для ...
Новая биология

Новая биология

Концепция курса. ИУМК “Новая биология” предназначен для 6-9 классов средней общеобразовательной школы. Содержание курса отличается от традиционного ...
Общая биология

Общая биология

План:. 1.Общая биология- комплексная наука об общих закономерностях живой природы. 2.Общие признаки живого. 3.Уровни организации живой природы. 4.Роль ...
Наука биология

Наука биология

Наука биология. О чем? Когда? Для чего? Биология. Биология – это учение о жизни, или наука о живой природе. логос" - учение биос" - жизнь. Разделы ...
Важная биология в икт

Важная биология в икт

Применение нашего компьютера:. моделирование биологических систем организация и хранение информации документооборот обучение экологические ГИС интернет-технологии. ...
Занимательная биология и химия

Занимательная биология и химия

Первый раунд. «Музыкально-биохимический хит» №1. Назовите разнообразие тропических плодов, о котором поется в одной из песен группы «Блестящие». Ответ: ...
Молекулярная биология гена

Молекулярная биология гена

План лекции:. Ген – определение, классификация. Понятие о мутоне, реконе, цистроне. Строение гена у про- и эукариот. Регуляторная и кодирующая субъединицы ...
Впр биология 2017 год (образец)

Впр биология 2017 год (образец)

Инструкция по выполнению работы. Проверочная работа включает в себя 16 заданий. На выполнение работы по биологии отводится 1 час 30 минут (90 минут). ...
Веселая биология

Веселая биология

Конкурсы. 1. Разминка «Биологические шарады» 2. Веселые загадки 3. Верните зверей в слова 4. Одни словом 5. Черный ящик 6. Ребусы. Биологические шарады. ...
Что? где? когда? занимательная биология

Что? где? когда? занимательная биология

Вопрос 1. Чем интересны эти земноводные в особенностях размножения и заботе о потомстве? ОТВЕТ. Особенности связаны с: жаба-повитуха наматывает ленты ...
Наука биология и ее значение в нашей жизни

Наука биология и ее значение в нашей жизни

Что такое биология? Биология – наука о жизни, о живых организмах, обитающих на Земле. Что изучает биология? Биология изучает строение и жизнедеятельность ...
Экология и биология даурской пищухи

Экология и биология даурской пищухи

Актуальность. Республика Тыва является составной частью Алтая-Саянского экорегиона, который входит в список, определенный Всемирным Фондом дикой природы ...
Ботаника и биология

Ботаника и биология

Г. Галилей (1564—1642). Развитие цитологии. Р. Гук (1635—1703). Антони ван Левенгук (1632—1723). Линзы Левенгука. Современные увеличительные приборы. ...
Гуморальная регуляция жизнедеятельности организма. эндокринная система человека

Гуморальная регуляция жизнедеятельности организма. эндокринная система человека

Часто можно слышать выражение, что все в организме контролируется нервной системой. Как осуществляется этот контроль? Неоднократно мы на уроках биологии ...
Пищеварительная система и ее строение

Пищеварительная система и ее строение

Пищеварительный аппарат 1 — околоушная железа; 2 — зубы; 3 — полость рта; 4 — глотка; 5 — язык; 6 — подъязычная железа; 7 — поднижнечелюстная железа; ...
Опорно-двигательная система человека

Опорно-двигательная система человека

Показать Скрыть. 1-череп, 2-ключица, 3-лопатка, 4-грудная клетка, 5-плечевая кость, 6-рёбра, 7-позвоночник (поясничный отдел), 8-кости таза (подвздошная ...

Советы как сделать хороший доклад презентации или проекта

  1. Постарайтесь вовлечь аудиторию в рассказ, настройте взаимодействие с аудиторией с помощью наводящих вопросов, игровой части, не бойтесь пошутить и искренне улыбнуться (где это уместно).
  2. Старайтесь объяснять слайд своими словами, добавлять дополнительные интересные факты, не нужно просто читать информацию со слайдов, ее аудитория может прочитать и сама.
  3. Не нужно перегружать слайды Вашего проекта текстовыми блоками, больше иллюстраций и минимум текста позволят лучше донести информацию и привлечь внимание. На слайде должна быть только ключевая информация, остальное лучше рассказать слушателям устно.
  4. Текст должен быть хорошо читаемым, иначе аудитория не сможет увидеть подаваемую информацию, будет сильно отвлекаться от рассказа, пытаясь хоть что-то разобрать, или вовсе утратит весь интерес. Для этого нужно правильно подобрать шрифт, учитывая, где и как будет происходить трансляция презентации, а также правильно подобрать сочетание фона и текста.
  5. Важно провести репетицию Вашего доклада, продумать, как Вы поздороваетесь с аудиторией, что скажете первым, как закончите презентацию. Все приходит с опытом.
  6. Правильно подберите наряд, т.к. одежда докладчика также играет большую роль в восприятии его выступления.
  7. Старайтесь говорить уверенно, плавно и связно.
  8. Старайтесь получить удовольствие от выступления, тогда Вы сможете быть более непринужденным и будете меньше волноваться.